
2020 年,Google DeepMind 开发的人工智能系统 AlphaFold 2,将蛋白质结构预测从传统实验方法的 " 数年时间 " 缩短至 " 几分钟到几小时 ",且精度达到实验测定水平,解决了困扰生物学界 50 年的 " 蛋白质折叠难题 "。
2024 年,AlphaFold 2 的开发者 Demis Hassabis 和 John Jumper 也因此获得诺贝尔化学奖。这一里程碑式突破开启了 AI 在生物医学从概念验证迈向实际应用的分水岭—— AlphaFold 时刻。
第二个 "AlphaFold 时刻 " 即将来临。
2025 年 12 月 16 日,成立仅 1 年 9 个月的生物科技初创公司 Chai Discovery 宣布完成 1.3 亿美元的 B 轮融资,投后估值达到 13 亿美元(约合 92 亿元人民币),正式跻身 AI 制药独角兽行列。这距离其上一轮 7000 万美元的 A 轮融资,仅过去了不到四个月。
这家初创企业正在利用前沿 AI 技术加速药物发现,核心目标是打造一个 " 分子计算机辅助设计套件 ",实现从零开始设计完整疗法,最终将生物学从 " 描述性科学 " 转变为 " 工程学科 "。
目前,公司已开发出两款 AI 模型—— Chai-1 和 Chai-2,用于预测和重编程生化分子,如蛋白质、小分子、DNA 和 RNA 等之间的相互作用。其中,Chai-2 带来了类似 AlphaFold 2 的突破性变革。它在零样本抗体设计实验中,成功率高达 15%-20%,相比之下,传统的计算方法成功率仅约 0.1%,实现了百倍效率提升,直接改变了该环节的成本与时间逻辑。
自 2024 年成立以来,Chai Discovery 完成了 3 轮融资,总融资额达 2.3 亿美元,获得了 OpenAI、Thrive Capital、Menlo Ventures、General Catalyst、Oak HC/FT 等机构的连续押注。

关于此次 B 轮融资资金,Chai Discovery 将用于加速研发、模型开发和商业化。目前,公司正在全球范围内大力招聘,计划在未来一年内扩大工程团队规模。
01 从哈佛宿舍到硅谷
Chai Discovery 的故事,是一个典型的 "AI 时代生物技术革命 " 叙事:一群对人工智能与生命科学交叉充满热情的极客,在经历了个人成长、职业积累和技术拐点的洗礼后,于关键时刻汇聚在一起,创立公司并实现快速增长。

从左到右依次为 Joshua Meier、Jacques Boitreaud、Matthew McPartlon 和 Jack Dent
图源:Genetic Engineering & Biotechnology News
创始人兼 CEO Joshua Meier 出生于 1996 年,从 4 岁就开始对科学产生浓厚兴趣,特别是科学、历史、创业和古希伯来文本等领域。他被描述为一个 " 天生好奇 " 的孩子,早年就展现出跨学科思维。
高中时期,Meier 就已展现出过人的创业天赋和科研实力。16 岁时,Meier 牵头创立生物技术公司 Provita Pharmaceuticals,公司完全由高中生组建和运营,专注于两个创新方向:研发减少血友病患者注射频率的医疗器械,以及探索通过蚊子传播疫苗的 " 飞行注射器 " 技术。其中," 飞行注射器 " 项目成功入围谷歌科学挑战赛,还登上《科学美国人》杂志。
次年,17 岁的 Meier 斩获多项国家级科技奖项,包括西门子科学竞赛全国第四名和英特尔科学人才搜索(Intel Science Talent Search)全国第四名,以及总额达 8 万美元的赛事奖金。
后来,Meier 进入哈佛大学攻读计算机科学和化学双学位及计算机科学硕士学位。在哈佛期间,他就已崭露头角,早早开始接触机器学习与生物学的交叉应用。此外,他还加入 CRISPR-Cas 基因编辑技术先驱之一张锋的实验室,担任研究助理,帮助其开发机器学习平台,用于设计 CRISPR 筛查实验。
毕业后,Meier 先在 OpenAI 从事生成式大模型研究,随后加入 Meta FAIR(Facebook AI 研究),担任核心科学家,主导开发首个 Transformer 架构蛋白质语言模型 ESM-1b,该模型被生物制药行业广泛使用。2021 年,Meier 加入 AI 制药公司 Absci 并担任首席 AI 官,带领团队开发生成式 AI 模型用于创造新型蛋白质疗法。
另一位联合创始人 Jack Dent 担任公司总裁。Dent 比 Meier 小一岁,同样毕业于哈佛大学计算机科学专业。两人是大学同学兼室友,在校期间就结下了深厚友谊,曾共同参与 TaxiLater 应用开发,解决预约 Uber 的实际难题。毕业后,Dent 加入全球支付巨头 Stripe,担任核心工程与产品负责人。
尽管毕业后各奔东西,但他们保持着每 3-6 个月交流一次的习惯,Meier 不断向 Dent 分享他在 AI 药物设计领域的研究进展。在一次交流中,他向 Dent 展示了 " 以原子级精度设计分子 " 的可能性,这打动了 Dent,让他觉得相比之下 " 其他项目都显得不那么重要 ",并决定放弃 Stripe 的高薪职位,与其共同创业。
2024 年 3 月,Chai Discovery 在美国加利福尼亚州旧金山正式成立。选择此时创业并非一时冲动,而是基于对技术成熟度的判断。他们认为,谷歌 DeepMind 的 AlphaFold 2 在 2022 年基本解决了蛋白质折叠问题,而扩散模型和大语言模型(LLM)的突破,为将结构预测推进到 " 分子生成 " 创造了条件。Meier 后来表示,这是一次经过深思熟虑的 " 押注 ",最佳创业窗口期可能只有一到两年。
Matthew McPartlon 和 Jacques Boitreaud 是其他两位联合创始人,前者在多家技术生物公司负责机器学习领导工作,后者在法国 AI 制药公司 Aqemia 领导团队,专注将机器学习工具应用于小分子发现。
02" 药界 ChatGPT"
首先需要了解的是,现代药物研发的关键在于针对导致疾病的特定靶点蛋白进行设计。这类似于治疗需要找准核心的发病机制。通过精准干预这个关键的分子 " 开关 ",药物能够在尽可能减少对正常细胞影响的前提下,达到治疗效果。
然而,这一过程长期面临根本性挑战。首先,仅解析靶点蛋白的三维结构就可能耗时数年且成本高昂;其次,在海量无限的化学空间中寻找并优化能与靶点精准结合的分子,如同大海捞针,依赖大量试错。这导致一款新药的平均研发周期长达 10-15 年,耗费数十亿美元,且失败率极高。
Chai Discovery 正在为这些问题提供 AI 解决方案,并已取得显著进展。
刚起步时,公司团队规模不到 10 人,挤在旧金山一间办公室开展工作。创始成员直接参与模型开发,并在几个月后快速推出首个基础模型 Chai-1。

图源:Chai Discovery
Chai-1 是多模态分子结构预测基础模型,其核心突破在两方面:一是开源属性,它是首个完全开源的 AlphaFold3 复现版本,采用 Apache 2.0 许可证,明确允许免费商业使用,打破了 AlphaFold3 仅开放学术场景的使用限制,降低了行业技术应用门槛。二是性能表现,在 PoseBusters 等权威基准测试中,其预测准确率与 AlphaFold3 相当甚至更优,尤其在单序列输入、无需多序列比对的复杂场景下,仍能保持稳定的高精度输出。
Chai-1 的核心定位是高精度生物分子结构预测,具备跨分子类型的统一预测能力,可精准解析蛋白质、小分子、核酸等多种核心生物分子的三维结构,精度达到 " 原子级显微镜 " 水准。这一步恰好解决了药物设计的核心前提——让药物分子与靶点蛋白精准匹配,若无法清晰解析靶点蛋白的精确空间结构,后续设计便无从谈起。
技术突破快速转为市场认可,Chai-1 发布当日,公司同步宣布完成近 3000 万美元种子轮融资,获得 OpenAI、Thrive Capital 及 Dimension 的支持。
不到一年,Chai Discovery 便实现技术迭代升级。2025 年 6 月,公司正式发布多模态生成式 AI 模型—— Chai-2。相较于 Chai-1 的 " 结构预测 ",Chai-2 实现了从 " 预测 " 到 " 创造 " 的跨越。

图源:Chai Discovery
Chai-2 的核心亮点是 " 零样本 " 从头抗体设计,仅需输入靶点抗原信息,就能直接生成全新的、具有结合活性的抗体或微型蛋白的序列和 3D 结构。实验数据显示,其成功率平均达到 15.5%-20%,相较于传统计算方法仅约 0.1% 的成功率,效率提升超 100 倍。更重要的是,Chai-2 能针对传统上 " 无药可靶向 " 的 G 蛋白偶联受体等靶点生成高亲和力抗体,这被业界视为通过纯计算方式实现的重大突破。
这意味着,一个过去耗资数百万美元、历时数年的早期发现难题,现在可能被缩短至数周内解决。
并且,与仅能设计蛋白质片段的许多模型不同,Chai-2 能够生成长度完整的抗体。设计分子在原子级精度与实验结构一致,86% 的设计达到可直接进入早期药物开发的标准。
现在,Chai-2 被业内形象地称为 " 药界 ChatGPT",因为它实现了从 " 读分子 " 到 " 写分子 " 的改变。与 AlphaFold 专注于 " 预测蛋白质结构 " 不同,Chai-2 致力于 " 创造所需蛋白质 ",即将开启生成式 AI 在药物研发领域的全新应用场景。
随着 B 轮融资的完成,Chai Discovery 正在推进商业化进程,拓展合作伙伴关系,推动其平台在更多生物制药公司中的应用。
03 AI 制药的新阶段
如果说 AlphaFold 2 解决的是 " 看清 " 的问题,那么 Chai-2 则更进一步,解决的是 " 创造 " 的问题。AlphaFold 2 像一台超高精度显微镜,让科学家能快速地看到几乎所有蛋白质的形状。Chai-2 则像一个分子生成器,能根据靶点直接设计出全新的、可能成为药物的抗体。
这一跨越对制药行业的意义在于,它有望从根本上解决行业长期面临的 " 高投入、低产出 " 难题。
与之对应,Chai Discovery 未来将打造一个 " 分子的计算机辅助设计套件 ",让生物学家能像工程师一样,可预测、可编程地设计生命分子。正如其创始人 Meier 所言,未来最强的抗体工程师可能不再是传统的生物学博士,而是懂得如何与 AI 协作的 " 分子提示词工程师 "。
尽管 AI 设计的分子仍需经过漫长且严格的临床实验验证,但 Chai Discovery 无疑代表 " 生成式 AI 制药 " 的前沿方向——不局限于筛选,而是直接创造全新分子,以攻克传统难以解决的靶点。
在全球范围内,类似的竞争正聚焦于生成式 AI 的工程化能力。在国内,这一赛道同样活跃,据不完全统计,已有上百家公司在此布局,部分企业已在技术突破和商业化方面取得实质性进展。

市场分析认为,尽管在底层通用生成模型方面与国际顶尖公司存在差距,但国内企业在特定靶点、临床数据应用及本土市场结合方面正快速发展。中国在政策与临床资源整合上的优势,未来可能催生全球级的 AI 医药研发服务平台。


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