西北农林科技大学国家肉牛改良中心主任昝林森团队联合相关科技企业,成功研发 " 中国黄牛 1 号 "50K 育种芯片并正式对外发布。该液相芯片是团队继 2021 年 1 月成功开发首款中国黄牛高密度 SNP(单核苷酸多态性)固相芯片并打破肉牛育种芯片国际垄断后,在牛分子育种技术领域取得的又一重大突破。
昝林森团队运用生物信息学,对以秦川牛为代表的分布于我国西北、华东、华中、华南、西南、东北等 6 个地理区系的地方黄牛品种特异性位点进行精准筛选,并整合多年来在生长、肉质、繁殖及抗病等性状相关功能位点的研究成果,成功研发 " 中国黄牛 1 号 "50K 育种芯片,该芯片具有检测成本低、选择准确性高等特点,实现中国黄牛快速、精准、高效选育,为地方黄牛品种保护、定向选育和高效利用提供了强有力技术支撑,也为我国肉牛种业高质量发展注入了新的动力。
该芯片以中国五大良种黄牛为主,涵盖中国 6 个地理区系 38 个黄牛品种基因组重测序数据,同时包含关键性状相关功能位点 18500 个,为精准育种提供了科学依据。同时,在 38 个中国黄牛品种近 30TB 基因组重测序数据分析基础上,芯片为上述黄牛品种量身定制了专属的鉴定位点,能够精准识别其独特的基因标识,为中国黄牛种鉴定与保护提供了有力支撑。
利用该芯片分别对秦川牛、南阳牛、鲁西牛和延边牛四个品种共计 28 个个体进行了 SNP 位点检测,对存在地理差异的 10 个品种共 47 个个体进行检测,结果表明 " 中国黄牛 1 号 "50K 育种芯片位点选择合适、芯片设计合理,分型结果表现优异,能够满足大量样本的检测需求。
多年来,聚焦中国黄牛代表性品种——秦川牛,昝林森团队创立了四级保种选育扩繁模式,采用 " 表型 + 基因型 " 选种方法,大幅提升了秦川牛生长速度和产肉性能,加速了良种定向选育扩繁,培育秦川牛肉用新品系 1 个,并构建了全产业链开发技术标准体系,实现了良种良法配套和节本增效。2023 年,秦川牛成为全国十大优异畜禽遗传资源中唯一入选的牛品种。
来源 / 陕西省教育厅
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