深圳晚报 2021-12-01
深晚报道|华大智造助力新冠变异毒株奥密克戎溯源
index_new5.html
../../../zaker_core/zaker_tpl_static/wap/tpl_font3.html

 

近日,超强新冠病毒变异株 Omicron(奥密克戎,B.1.1.529)的出现,为疫情防控监测系统带来了巨大挑战。12 月 1 日,深晚记者从深圳华大智造获悉,华大智造 ATOPlex V3.0 试剂盒能够稳定地制备覆盖毒株全长序列的测序文库,搭配 DNB 测序和分析系统即可分型所有流行毒株。从 Alpha 到 Omicron,只需一套建库试剂,就可针对新型毒株提供简单有效的监测。

根据 Nextclade 最新的数据,Omicron 变异株包含 61 个氨基酸突变,对应到核酸序列上有 50 个新型变异,包括 6 个缺失突变和 44 个碱基替换突变。其中,刺突蛋白上有 30 多个突变,包括关键部位 ACE2 受体 RBD 区域的 10 个突变,很可能影响到现有疫苗的疗效。

目前,基于多重 PCR 的测序技术是新冠毒株监测的主流技术。基于多重 PCR 核心技术,华大智造 ATOPlex 平台推出 V3.0 版建库试剂盒应对疫情挑战。ATOPlex V3.0 试剂盒采用双保险引物设计,在一次实验中同时对病毒基因组进行 2 次扩增,任意一管都可以扩增出接近新冠全长序列,有效降低由于病毒突变带来的失败风险。

华大智造在第一时间拿到 Omicron 序列后就完成了对 ATOPlex 试剂盒的溯源性能评估,ATOPlex V3.0 建库试剂盒联合 DNBSEQ 测序系统能够有效对 Omicron 毒株进行分析,基因组覆盖度超过 99.2%,在鉴定新型突变的同时获取完整基因组序列。

▲华大智造助力新冠变异毒株奥密克戎溯源

ATOPlex V3.0 联合 DNBSEQ 测序系统,在 18 小时内就能完成毒株全基因组组装和分型工作,帮助公共卫生监测系统快速、持续地对新冠变异情况进行跟踪。

据悉,自疫情发生以来,华大智造通过核心产品基因测序仪和自动化设备为全球 70 余个国家疫情防控提供工具支撑。随着疫情的不断变化,华大智造将持续更新和优化包括建库测序系统在内的产品及平台,为新型突变和疫情监测提供更有力的工具保障,助力全球抗疫。

深圳晚报记者 杜婷

相关标签

华大智造 新冠 疫苗 新冠病毒 核心技术
相关文章
评论
没有更多评论了
取消

登录后才可以发布评论哦

打开小程序可以发布评论哦

12 我来说两句…
打开 ZAKER 参与讨论