深圳晚报 2022-01-11
深晚报道丨多个秋海棠属植物基因组被破译 仙湖植物园研究成果在《新植物学家》正式发表
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近日,由深圳市仙湖植物园与深圳华大生命科学研究院牵头完成的秋海棠属植物基因组研究成果《Genomes shed light on the evolution of Begonia, a mega-diverse genus》,在植物学领域国际权威刊物《新植物学家》(New Phytologist)正式发表。

仙湖植物园植物研究中心李凌飞博士、董珊珊博士、李娜以及华大生命科学研究院陈晓丽博士、方东明副研究员、郭兴博士为论文共同第一作者。另外,英国爱丁堡皇家植物园、西双版纳植物园、南宁植物园、上海辰山植物园、新加波植物园、北京植物研究所、昆明植物研究所、福建农林大学、南京农业大学、华南农业大学、广东省农科院、佛罗里达大学、比利时根特大学等国内外多个科研院校合作者参与了该研究。华大生命科学研究院刘欢研究员和仙湖植物园张寿洲研究员为共同通讯作者。该项研究工作得到了国家重点研发计划项目、深圳市城管局科研项目等资金的支持。

最新发布的研究成果中,研究团队完成了桑寄生状秋海棠(Begonia loranthoides)、铁十字秋海棠(Begonia masoniana)、黑武士秋海棠(Begonia darthvaderiana)、和盾叶秋海棠(Begonia peltatifolia)4 种秋海棠属植物全基因组组装,并完成了 74 个全球代表性的种类的浅层基因组测序。同时,该研究还发现,秋海棠属祖先在大约 3500 万年前经历了一次特有的全基因组加倍事件,该事件对秋海棠属植物多样性演化和耐阴适应性具有重要贡献。该研究成果为揭示秋海棠属植物多样性形成及适应性进化提供了新的见解,并为秋海棠属植物后基因组学研究提供了重要的参考。

▲基因组测序 4 种秋海棠属植物。受访者供图

据了解,秋海棠属是植物界中的超级大属,种类极为丰富,总数超过 2000 种。该属隶属于葫芦目秋海棠科,与之关系较近的是同属的葫芦科,常见的冬瓜、南瓜、黄瓜、丝瓜、葫芦、西瓜等都是葫芦科的著名果蔬。秋海棠属于典型的阴生植物,主要分布在赤道附近的热带及亚热带地区,多数种类生活在林下、峡谷、瀑布、溶洞等阴湿的地方。此外,秋海棠属植物叶型、叶斑变化多样,花色丰富,兼观叶与观花于一身,是现今最具应用价值的园艺观赏花卉之一。

自 2008 年起,仙湖植物园已收集保育 400 余种秋海棠属植物种质资源,成为国内该类群收集种类最多的单位之一。近年来,仙湖植物园充分利用秋海棠属植物资源收集优势,依托深圳市南亚热带重点实验室开展了系统的科学研究和系列科普展览活动,为专业人士和普通市民提供了秋海棠属植物的重要学习及交流平台。

深圳晚报记者 李晶川

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