图 1 ｜ eDNA 宏条形码技术原理与工作流程

现阶段海洋牧场鱼类资源调查普遍采用流网、地笼、延绳钓等传统网具。人工鱼礁礁体结构复杂，网具投放后容易缠绕、破损，大幅降低渔获效率，增加调查成本。此外，网具拖拽、布设作业会直接扰动礁区底质与生物生境，产生人为干扰，存在调查得的物种完整性不足，难以精准还原海域鱼类群落真实状况。

02.eDNA：非入侵的第三条路

eDNA 宏条形码技术（eDNA metabarcoding）利用通用引物扩增，经高通量测序后比对参考数据库，可一次性获取样本中所有鱼类物种信息。核心优势在于非入侵、高灵敏、广覆盖——同样一片海，能识别的鱼种数往往是传统调查的数十倍。

图 2 ｜类 eDNA 测序检出的鱼类物种信息与捕捞获得的鱼类物种信息

· 测序平台：联合华大智造 DNBSEQ-G99，PE300 双端测序

· 参考数据库：基于 MitoFish 和 GenBank 自建海洋脊椎动物线粒体库，覆盖 42,015 种脊索动物，注释精准到种

· 本地库优势：黄渤海鱼类 12S rDNA 本地数据库，注释准确性高于 NCBI，可排除非目标物种干扰并纠正注释错误

· 分析内容：物种注释 + Alpha/Beta 多样性 + 群落组成结构 + 稀有物种鉴定 + 差异物种识别 + 季节动态 + 随机森林环境因子关联，120 余项分析模块

图 3 ｜分析流程模块图

图 4 ｜ eDNA 序列数与传统相对丰度相关性

拟合度：M-Mito R ² =0.601；PS1 R ² =0.451，eDNA 相对序列数与鱼的丰度显著正相关

图 5 ｜ 康威河 α 多样性的季节时间变化

季节对鱼类物种以及水生节肢动物、总节肢动物、环节动物、线虫和轮虫的 ASVs 的 β 多样性也有影响。

从一瓢海水到一份物种清单，凌恩 为您提供 eDNA 全流程技术服务——采样指导、实验建库、高通量测序、生信分析、报告解读，一站式解决。

42,015 种海洋脊椎动物库

1.eDNA metabarcoding provides biodiversity estimates comparable to conventional sampling methods. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences,2026

2.An integrated spatio-temporal view of riverine biodiversity using environmental DNA metabarcoding.Nature Communications,2025.

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